如何應(yīng)對(duì)細(xì)胞株系開(kāi)發(fā)數(shù)據(jù)挑戰(zhàn)

細(xì)胞株開(kāi)發(fā)是眾多具有重大數(shù)據(jù)挑戰(zhàn)的工作流程之一。與任何篩選過(guò)程一樣，樣本通量帶來(lái)了數(shù)據(jù)量的挑戰(zhàn)。當(dāng)使用多種分析工具以不同格式生成不同類(lèi)型的數(shù)據(jù)時(shí)，這就變得更加具有挑戰(zhàn)性。這不僅需要在不同的孔板和孔之間移動(dòng)數(shù)據(jù)，而且整個(gè)過(guò)程可能會(huì)延長(zhǎng)數(shù)月。在整個(gè)過(guò)程中，必須對(duì)數(shù)據(jù)進(jìn)行追蹤，以確保進(jìn)入生產(chǎn)的任何細(xì)胞株都有必要的歷史數(shù)據(jù)（例如單克隆性的證明），并且為了報(bào)告需要，所有的數(shù)據(jù)都可以被方便地訪問(wèn)。在這里，我們將描述在Biomek i7工作站（圖1）上自動(dòng)化細(xì)胞株開(kāi)發(fā)如何克服與此工作流程相關(guān)的許多數(shù)據(jù)挑戰(zhàn)。

圖1：Biomek i7工作站與三方設(shè)備整合一起被用于自動(dòng)化細(xì)胞株開(kāi)發(fā)工作流程。

作為液體轉(zhuǎn)移步驟的一部分，Biomek軟件會(huì)自動(dòng)移動(dòng)數(shù)據(jù)，因此數(shù)據(jù)可以隨著樣本移動(dòng)而并行移動(dòng)（圖4）。同時(shí)，數(shù)據(jù)也可以存儲(chǔ)在DART數(shù)據(jù)庫(kù)中，未來(lái)任何時(shí)候掃描孔板條碼時(shí)，相應(yīng)的數(shù)據(jù)都會(huì)被自動(dòng)檢索出來(lái)。DART提供了不同時(shí)間交互的方法之間的鏈接（圖4）——在諸如細(xì)胞株開(kāi)發(fā)這樣的長(zhǎng)時(shí)間工作流程中，這是一個(gè)關(guān)鍵組件。

圖3：自動(dòng)化數(shù)據(jù)處理示意圖。

除開(kāi)存儲(chǔ)和利用數(shù)據(jù)，DART數(shù)據(jù)庫(kù)可以通過(guò)多種方便的方式訪問(wèn)。為了以用戶友好的方式進(jìn)行快速可視化，可通過(guò)Chrome瀏覽器直接實(shí)時(shí)查看（圖6A），同時(shí)可以使用DART報(bào)告生成器在Excel中生成報(bào)告。

圖6：DART數(shù)據(jù)查看和報(bào)告。

在任何實(shí)驗(yàn)中產(chǎn)生的數(shù)據(jù)使實(shí)驗(yàn)有價(jià)值。數(shù)據(jù)處理中的任何錯(cuò)誤都可能消除這個(gè)價(jià)值，甚至可能將研究進(jìn)程推向錯(cuò)誤的方向。對(duì)于像細(xì)胞株開(kāi)發(fā)這樣長(zhǎng)達(dá)數(shù)月的工作流程，數(shù)據(jù)丟失或錯(cuò)誤的風(fēng)險(xiǎn)更大，因此，確保數(shù)據(jù)完整性的工具至關(guān)重要。Biomek和DART軟件通過(guò)使數(shù)據(jù)完整性過(guò)程自動(dòng)化且易于獲取，可以為細(xì)胞株開(kāi)發(fā)過(guò)程提供真正的價(jià)值。

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*以上內(nèi)容涉及設(shè)備僅適用于科研和工業(yè)，不用于臨床診斷。